一天之后RE1醒了，昏迷的原因是因为意识能量在瞬间超出负荷，但是因为没有外伤，所以也没有什么治疗措施，只是输着营养液。
清醒后的他看了一遍降落时的录像，在他昏迷前一刻，本应继续翻转的航天飞机却突然重新持平，机身下方空间开始扭曲并托着飞机缓缓着陆，没有产生剧烈冲击。接下来的画面就是地勤人员飞速的赶到，将他抬了出来。
“从视频上的情况分析，基本可以确定意识能量可以通过使用者接触第三方物体扩展应用范围，但是根据目前已知情报来看，意识能量还不能外放过远距离，也就是不能进行远程攻击”说完鲁尼便将更详细的资料放在了全息屏幕上。
“现在出现的HG意识部队应该是第一批作品，你和自称10号的意识能量者接触之后没多久就在朝鲜半岛遇到了双子攻击，而且根据他们能量使用程度来看，稳定性要远高于你第一次接触的10号，所以你也不能太过于掉以轻心”
RE1很明白鲁尼部长的意思，虽然意识能量不等于1+1那么简单，但是如果任其继续发展下去后果很可能不堪设想，自己这次昏迷就是因为能量使用透支，他也需要继续锻炼这种能力，在提升能量输出的情况下尽可能的减小自己身体负担。
会议很快就结束了，接下来的一段时间内世界可以安静一段日子了，新的RE需要更系统的重整，增加实力；HG也需要重新评估世界格局，完成第二阶段计划；而世界上各个大国也都在埋头修炼，致力于新型武器研发。
因为干沉了日本，部队中原来对RE1作为最高领导人有意见的一大部分士兵态度突然180°的转变，誓死效忠RE1，部队情绪空前高涨。
经过将近两个月的分析研究，RE也终于拥有了隐身作战服，同样命名为vision（幻视），三艘‘加百利’超级潜艇也开始进行加强，改造完毕之后虽然效果还达不到‘女武神’级别但是相比于原来，航速，最大潜度，噪音控制都大大增强。
不光是武器性能的提升，原EOS作战人员能力也得到了巨大增幅，由原AT小组成员现三叉戟小队进行训练，他们首先消除的就是士兵的羞耻心和道德观念，战斗过程中最不需要的就是废话和怜悯，近身格斗必须招招致命，能开枪绝对不用刀。
RE1也在不停的对自身进行强化，除了每天的格斗练习之外，就是意识能量的控制，尤其加强了对使用第三方物品进行能量释放的控制，这也是因为RE的科技人员要求的，他们想为他设计一套近身攻击武器，虽然RE1认为身体本身就是武器，但还是配合了他们。
很快新武器便送到了他的面前，一个类似剑柄的物体。
“难道你要给我一把剑吗？难道我看起来像骑士？”RE1看着手里这不足20公分长，直径2公分左右的东西问着。
“长官需要将意识能量传递至剑柄才可以看到效果”
RE1单手紧握剑柄，将能量作用于剑柄之上，这时一道发着荧光绿色光柱出现了，但是长度并不稳定，乎长乎短，长度在1米左右。
“这就是意识能量的实体形态，呈现这种荧光绿是因为我们在剑柄中加入了13号能源，而正因为13号能源的存在，意识能量才可以稳定的保持这一形态，剑身拥有意识能量的所有特性”。
“剑身有意识能量一切特性？这个有意思，你是说我想实现撕裂效果时，它也可以实现吗？”说完RE1便提着这把剑离开了房间，来到了训练场地。
场地中间放着一辆用于训练的损坏的‘猎虎’战车，RE1慢慢稳定好能量输出，随后向车身快速做了一个下劈，随着荧光绿的剑身莫入车身，坚固的金属随着一阵金属撕裂声音，车身开始裂开，这是连他自己也没想到的结果。
“13号能源作为催化剂，将你的能量本身也进行了增幅”研究员自豪的说道。
“不错，是个好东西”满意的看着手中的能量剑。
接下来的日子，他都在熟悉这件新武器，然后根据使用时候遇到的问题让研究员重新设计制作，当最终版本完成时，手里的剑柄已经跟之前的完全不同了，剑柄和护手也变得更宽，而且剑柄同样可以输出意识能量。
这样做是为了在需要时候增加剑身宽度，以达到抵挡攻击的作用，并且增加攻击范围。
RE1得到了他的大杀器，而HG呢？
随着格陵兰岛基地内秘密实验室的门打开，一位浑身**的女性走了出来，标志着第二阶段计划已经完成。
她身材纤细，没有普通战士那样的黝黑皮肤，眼神冰冷但很有神，头发是火红色，走出实验室的她迅速被三名研究人员迎上，没有在做任何数据检测，只是将手中的推车放在了她的身边。
没有任何表情，没有任何话语，拿起推车上的一件黑色紧身衣穿了起来，衣服很紧，将本身就已经相当完美的身材包裹的更加凹凸有致。
穿完衣服，接着将车上其他装备一一穿戴完毕。
对于13号能源的应用，HG丝毫不差于RE，甚至在某些方便要强于对方，她的武器是双剑，和RE一样，同样配备了近身武器，不同的是双剑不是纯能量，而是实体，剑身由13号能源原石精炼而成，但是却呈现红色。
“我叫，墨格拉”这是她开口说的第一句话。
与此同时，赤井来到了他位于北美的个人住所，一座标准的日本建筑，这也是他最后的请求，换好那件自己最喜欢的和服来到庭院内，跪坐在冰冷的地面上，抬头看着看散发着温柔但略显冰冷光芒的月亮。
自己面前放着一把武士刀，而且用名贵的布料在下垫着，喝了一小口最喜欢的清酒，然后拿起刀，猛的将刀刺入自己腹部，然后从左至右缓缓移动，接着猛地上提，肠脏开始溢出，但是此时赤井的表情却没有一丝痛苦，而是露出了诡异的笑容。